Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LmnaP48678 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms