Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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SrprbP47758 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrprbP47758 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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SrprbP47758 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SrprbP47758 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SrprbP47758 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SrprbP47758 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SrprbP47758 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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SrprbP47758 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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