Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf6P43028 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms