Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms