Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VhlP40338 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
VhlP40338 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
VhlP40338 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
VhlP40338 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms