Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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HmgclP38060 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HmgclP38060 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HmgclP38060 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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