Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms