Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms