Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpardP35396 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpardP35396 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpardP35396 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpardP35396 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpardP35396 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpardP35396 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpardP35396 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpardP35396 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpardP35396 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpardP35396 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpardP35396 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms