Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms