Protein–RNA interactions for Protein: P31240

Pdgfb, Platelet-derived growth factor subunit B, mousemouse

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Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfbP31240 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfbP31240 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PdgfbP31240 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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