Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms