Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp3P28862 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms