Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxraP28700 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxraP28700 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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