Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Hoxd10P28359 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hoxd10P28359 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hoxd10P28359 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hoxd10P28359 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hoxd10P28359 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hoxd10P28359 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Hoxd10P28359 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Hoxd10P28359 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Hoxd10P28359 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms