Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms