Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Xrcc5P27641 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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