Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms