Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
CftrP26361 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CftrP26361 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CftrP26361 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CftrP26361 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CftrP26361 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CftrP26361 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CftrP26361 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CftrP26361 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CftrP26361 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CftrP26361 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CftrP26361 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CftrP26361 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CftrP26361 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms