Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtmaP26350 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtmaP26350 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms