Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RdxP26043 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RdxP26043 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RdxP26043 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RdxP26043 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RdxP26043 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RdxP26043 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RdxP26043 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms