Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms