Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms