Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd247P24161 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms