Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms