Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms