Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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