Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms