Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csn1s1P19228 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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