Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18532 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18532 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18532 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18532 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18532 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18532 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18532 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms