Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms