Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Srp54P14576 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Srp54P14576 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Srp54P14576 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Srp54P14576 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Srp54P14576 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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