Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scd1P13516 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd1P13516 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms