Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms