Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FosbP13346 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FosbP13346 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FosbP13346 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FosbP13346 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FosbP13346 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FosbP13346 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FosbP13346 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FosbP13346 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FosbP13346 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FosbP13346 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms