Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nr4a1P12813 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nr4a1P12813 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nr4a1P12813 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nr4a1P12813 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nr4a1P12813 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nr4a1P12813 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nr4a1P12813 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nr4a1P12813 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nr4a1P12813 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nr4a1P12813 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nr4a1P12813 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nr4a1P12813 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nr4a1P12813 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nr4a1P12813 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms