Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms