Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf4P11403 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms