Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms