Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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