Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SparcP07214 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SparcP07214 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SparcP07214 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SparcP07214 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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