Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnfP06804 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnfP06804 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnfP06804 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnfP06804 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnfP06804 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnfP06804 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnfP06804 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TnfP06804 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TnfP06804 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TnfP06804 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TnfP06804 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TnfP06804 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TnfP06804 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TnfP06804 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TnfP06804 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms