Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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