Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01672 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01672 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01672 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01672 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01672 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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