Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Capns1O88456 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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