Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl22O88430 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms