Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srpk1O70551 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms