Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms