Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChkbO55229 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms