Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rpl35aO55142 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rpl35aO55142 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rpl35aO55142 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rpl35aO55142 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rpl35aO55142 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rpl35aO55142 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rpl35aO55142 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rpl35aO55142 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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